ภาพรวมของการจัดลำดับทั้ง Exome (WES)

การจัดลำดับทั้งภายนอก (WES) เป็นกระบวนการที่ใช้ในการระบุการเปลี่ยนแปลงในยีนของคุณ วิธีนี้ค่อนข้างใหม่ เมื่อเทคโนโลยีก้าวหน้า การวิจัยเพิ่มเติมและการใช้งานจริงก็คาดว่าจะเกิดขึ้น

การทดสอบทางพันธุกรรมกลายเป็นเรื่องธรรมดามาก คุณสามารถซื้อผลิตภัณฑ์ที่ใช้ตัวอย่างเส้นผมหรือน้ำลายเพื่อระบุลักษณะทางพันธุกรรมบางอย่าง และเพื่อเรียนรู้ว่าภูมิหลังทางชาติพันธุ์ใดเป็นส่วนหนึ่งของบรรพบุรุษของคุณ WES แตกต่างกันเล็กน้อยเพราะใช้เพื่อระบุความผิดปกติในยีนทั้งหมดของคุณ นั่นเป็นความจริงแม้ว่าการเปลี่ยนแปลงเหล่านี้จะไม่เชื่อมโยงกับโรคใด ๆ ก่อนหน้านี้ ตัวอย่างเช่น ไม่ใช่การทดสอบที่ถูกต้องเพื่อค้นหาการเปลี่ยนแปลงของยีนที่เฉพาะเจาะจง เช่น การกลายพันธุ์ของ BRCA2 ที่ระบุในมะเร็งบางชนิด

บทความนี้จะกล่าวถึงวิธีการทำงานของ WES และบทบาทที่อาจส่งผลต่อการดูแลสุขภาพโดยรวมของคุณ

ยีนทำงานอย่างไร

WES สามารถใช้เพื่อค้นหารูปแบบเพื่อค้นหาสาเหตุทางพันธุกรรมของโรคทางการแพทย์ การรู้พื้นฐานบางอย่างเกี่ยวกับพันธุศาสตร์จะช่วยให้คุณคิดเกี่ยวกับการใช้ WES ได้ นี่คือบางส่วน

โครโมโซมของคุณเป็นโมเลกุลที่มีรหัสพันธุกรรมของคุณ (คุณมีโครโมโซม 23 คู่ ซึ่งเรียกอีกอย่างว่าโมเลกุลดีเอ็นเอ) พวกมันประกอบด้วยเส้นยาวของโมเลกุลนิวคลีโอไทด์ ร่างกายของคุณอ่านลำดับยีนเหล่านี้เพื่อผลิตโปรตีนที่สำคัญ

ยีนและจีโนม

ลักษณะทั้งหมดของร่างกายสร้างขึ้นจากการสร้างโปรตีนที่เข้ารหัสโดยยีนของคุณ รหัสพันธุกรรมทั้งหมดนี้ สำหรับโครโมโซม 46 ตัวของคุณ เรียกว่า จีโนม.

Exons

ส่วนต่าง ๆ ของโมเลกุลดีเอ็นเอที่เข้ารหัสยีนเรียกว่าเอ็กซอน พวกมันผสมกับอินตรอนซึ่งเป็นลำดับนิวคลีโอไทด์ที่ไม่ได้กำหนดรหัสสำหรับลักษณะ ยีนหนึ่งอาจมีเอ็กซอนหลายตัวที่เข้ารหัสโปรตีนมากกว่าหนึ่งตัว Exons คิดเป็นเพียง 1% ถึง 2% ของ DNA ทั้งหมดของคุณ

แต่ละเอ็กซอนเริ่มต้นด้วยลำดับนิวคลีโอไทด์ที่ส่งสัญญาณการเริ่มต้นสร้างโปรตีน และจบลงด้วยลำดับที่บอกให้หยุดสร้างโปรตีน

เอ็กโซเม่

เอ็กซอนทั้งหมดในโครโมโซมทั้งชุดของคุณเรียกว่าเอ็กโซม จากนั้น WES จะพิจารณาภาพรวมทั้งหมดของคุณเพื่อระบุการเปลี่ยนแปลงที่อาจก่อให้เกิดโรคหรือปัญหาสุขภาพ

WES ค่อนข้างละเอียด และตรวจยีนทั้งหมดในร่างกายของคุณ จำไว้ว่ามันไม่ได้ตรวจสอบอินตรอนเลย Introns อาจมีผลต่อร่างกายของคุณ แต่นักวิทยาศาสตร์ยังไม่เข้าใจถึงผลกระทบนี้อย่างถ่องแท้ ตอนนี้ไม่ถือว่ามีความสำคัญเท่ากับอิทธิพลของเอ็กซอน

กระบวนการ

WES ใช้ตัวอย่างเลือดเพื่อวิเคราะห์ยีนของคุณ ทุกเซลล์ในร่างกายของคุณมีโครโมโซมทั้ง 46 ชุด ดังนั้นเซลล์เม็ดเลือดจึงทำงานได้ดีสำหรับการทดสอบประเภทนี้

WES สามารถรับการกลายพันธุ์ที่ทราบกันดีอยู่แล้วว่าก่อให้เกิดโรค นอกจากนี้ยังสามารถตรวจพบการเปลี่ยนแปลงในรหัสพันธุกรรมของคุณที่ยังไม่ได้เชื่อมโยงกับโรค

สถานที่รับการทดสอบ

มีแล็บมากมายที่ใช้ WES หากผู้ให้บริการด้านการดูแลสุขภาพของคุณต้องการทำเช่นนี้ คุณอาจต้องไปเจาะเลือดที่สำนักงานของผู้ประกอบวิชาชีพและสามารถส่งตัวอย่างไปที่ห้องแล็บเฉพาะทางเพื่อทำการอ่าน

คุณอาจตัดสินใจรับการทดสอบโดยไม่ต้องมีคำสั่งจากผู้ให้บริการด้านการดูแลสุขภาพ หากเป็นเช่นนั้น คุณสามารถติดต่อห้องปฏิบัติการที่ทำการทดสอบ WES โดยตรงและขอคำแนะนำเกี่ยวกับวิธีการทำการทดสอบจากพวกเขา

ค่าใช้จ่าย

เป็นสิ่งสำคัญที่คุณจะต้องตรวจสอบค่าใช้จ่ายในการทดสอบ คุณควรตรวจสอบว่าประกันสุขภาพของคุณจะครอบคลุมค่าใช้จ่ายในการทดสอบหรือไม่ เนื่องจาก WES ยังค่อนข้างใหม่ บริษัทประกันของคุณอาจครอบคลุมหรือไม่ครอบคลุมค่าใช้จ่ายก็ได้ ขึ้นอยู่กับนโยบายของบริษัทนั้นๆ

หากคุณกำลังวางแผนที่จะจ่ายเงินสำหรับการทดสอบด้วยตัวเอง ค่าใช้จ่ายอาจอยู่ระหว่าง 400 ถึง 1,500 ดอลลาร์

ข้อควรพิจารณา

หากคุณหรือบุตรหลานของคุณจะต้องทำ WES คุณต้องตระหนักถึงผลกระทบ มีหลายสิ่งที่ควรพิจารณาก่อนดำเนินการ WES รวมถึงข้อกังวลด้านความเป็นส่วนตัว แต่ยังรวมถึงวิธีที่คุณจะจัดการกับสิ่งที่คุณรู้เกี่ยวกับตัวคุณในตอนนี้ด้วย นี่เป็นพื้นที่หนึ่งที่คุณอาจต้องการนัดหมายการให้คำปรึกษาทางพันธุกรรม และให้ผู้เชี่ยวชาญหารือว่าผลการวิจัยมีความหมายต่อคุณอย่างไร

ความเป็นส่วนตัว

ผลลัพธ์ทางพันธุกรรมของคุณสามารถเป็นส่วนหนึ่งของเวชระเบียนของคุณได้ โดยเฉพาะอย่างยิ่งหากผู้ให้บริการด้านการดูแลสุขภาพสั่งการทดสอบของคุณและหากประกันสุขภาพของคุณจ่ายเงินให้ บริษัทประกันสุขภาพของคุณ บริษัทที่ทำการทดสอบ และผู้ขายรายใดรายหนึ่งอาจเรียนรู้ว่าคุณมียีนสำหรับลักษณะทางพันธุกรรมที่ทราบหรือไม่ ใครก็ตามที่แฮ็กเข้าไปในคอมพิวเตอร์ของพวกเขาหรือพบข้อมูล

ในบางกรณีนั่นอาจหมายถึงสมาชิกในครอบครัว ผลการทดสอบทางพันธุกรรมยังมีความหมายกับคนที่เกี่ยวข้องกับคุณและแบ่งปันลักษณะทางพันธุกรรมของคุณ มีกฎหมายคุ้มครองความเป็นส่วนตัวและระเบียบข้อบังคับที่ป้องกันไม่ให้เงื่อนไขที่มีอยู่ก่อนส่งผลกระทบต่อความคุ้มครองสุขภาพของคุณ อย่างไรก็ตาม ข้อมูลระดับนี้ไม่เคยเกิดขึ้นมาก่อน และอาจมีผลกระทบส่วนบุคคลหรือทางวิชาชีพ

ความตระหนักในความอ่อนแอต่อโรค

บางคนกังวลว่าการทดสอบทางพันธุกรรมจะเปิดเผยเกี่ยวกับสุขภาพของพวกเขามากกว่าที่พวกเขาต้องการทราบ โปรดจำไว้ว่าการทดสอบเหล่านี้ไม่ได้แสดงให้คุณเห็นถึงอนาคตทางการแพทย์ของคุณ นั่นเป็นเพียงกรณีที่มีเงื่อนไขเฉพาะบางประการในบางกรณีที่หายากมาก เช่น โรคฮันติงตัน

อย่างไรก็ตาม สิ่งที่ WES ทำได้คือเปิดเผยว่าบุคคลนั้นมีความเสี่ยงสูงต่อความผิดปกติทางการแพทย์บางอย่าง อันที่จริง อาจพบความผิดปกติมากกว่าหนึ่งอย่าง เนื่องจากการทดสอบ WES นั้นละเอียดถี่ถ้วน

การเปลี่ยนแปลงทางพันธุกรรมหลายอย่างเหล่านี้จะไม่นำไปสู่โรคหรือสภาวะที่เฉพาะเจาะจง นอกจากนี้ยังมีแนวโน้มว่าจะไม่มีใครสามารถบอกได้ว่าผลลัพธ์ของ WES มีความหมายต่ออนาคตของบุคคลอย่างไร หรือ “ความผิดปกติ” ทางพันธุกรรมชนิดใดที่จะทำให้เกิดโรคได้

ตัดสินใจสอบ

มีการทดสอบทางพันธุกรรมที่คล้ายกันหลายอย่างที่ประเมินโครโมโซมของคุณแตกต่างจาก WES และมีจุดแข็งและจุดอ่อนสำหรับการทดสอบแต่ละประเภท

การวิเคราะห์โครโมโซม

การวิเคราะห์โครโมโซมอาจเรียกว่า คาริโอไทป์. การทดสอบนี้สามารถวิเคราะห์โครโมโซมทั้งหมดของคุณเพื่อดูว่ามีการเปลี่ยนแปลงหรือไม่ เช่น สำเนาเพิ่มเติมหรือโครโมโซมที่ขาดหายไป นอกจากนี้ยังสามารถค้นหาการเปลี่ยนแปลงทางโครงสร้าง เช่น โครโมโซมที่ยาวขึ้นหรือสั้นลง

Karyotyping สามารถระบุเงื่อนไขเช่นดาวน์ซินโดรมด้วยโครโมโซม 21 เพิ่มเติม อย่างไรก็ตามไม่สามารถค้นหาการกลายพันธุ์ขนาดเล็กในยีนได้

ลำดับจีโนมทั้งหมด

ลำดับจีโนมทั้งหมดคล้ายกับ WES ที่ต่างกันตรงที่มันกว้างกว่า โดยจะพิจารณาจีโนมทั้งหมด รวมทั้งลำดับอินตรอนด้วย การจัดลำดับจีโนมทั้งหมดยังมีราคาแพงกว่า WES

การทดสอบทางพันธุกรรมระดับโมเลกุล

การศึกษานี้เรียกอีกอย่างว่าการทดสอบทางพันธุกรรมของ microarray โดยเปรียบเทียบส่วนเล็กๆ ของ DNA ของคุณกับยีนที่รู้จักหรือกับลำดับ DNA ที่เลือก พบการเปลี่ยนแปลงหรือการกลายพันธุ์ที่ทราบในพื้นที่เฉพาะของโครโมโซม

การทดสอบเหล่านี้มีประโยชน์หากคุณมีอาการของโรคที่เกิดจากการกลายพันธุ์ทางพันธุกรรมในตำแหน่งที่รู้จักของโครโมโซม ตัวอย่าง ได้แก่ โรคฮันติงตัน ดังที่ได้กล่าวไว้ก่อนหน้านี้ เช่นเดียวกับยีนมะเร็งเต้านมบางชนิด

การให้คำปรึกษาทางพันธุกรรม

เช่นเดียวกับการทดสอบทางพันธุกรรมประเภทอื่นๆ WES อาจให้ผลลัพธ์ที่ดูน่าตกใจหรือเข้าใจยาก สาขาวิชาพันธุศาสตร์เติบโตอย่างรวดเร็วจนรู้สึกว่ายากที่จะตามทัน แต่มีผู้เชี่ยวชาญที่ผ่านการฝึกอบรมด้านการให้คำปรึกษาทางพันธุกรรมเพื่อช่วยคุณจัดเรียงข้อมูลส่วนบุคคลดังกล่าว

ไม่ว่าคุณจะกังวลเกี่ยวกับโรคมะเร็งหลังจากผลการทดสอบที่น่าหนักใจ หรือคุณต้องการที่จะแน่ใจเกี่ยวกับการตั้งครรภ์โดยอาศัยประวัติครอบครัวของคุณเอง ผู้ให้คำปรึกษาทางพันธุกรรมสามารถช่วยอธิบายได้ว่าทำไมจึงต้องมีการทดสอบ หลายคนได้รับการฝึกอบรมด้านการดูแลก่อนคลอด กุมารเวชศาสตร์ เนื้องอกวิทยา และสาขาการแพทย์เฉพาะอื่นๆ

พวกเขาไม่ใช่หมอ อย่างน้อยก็ในกรณีส่วนใหญ่ แต่สิ่งเหล่านี้เป็นส่วนสำคัญของการรักษาพยาบาลของคุณและพร้อมที่จะหารือเกี่ยวกับผลการทดสอบและสิ่งที่พวกเขาอาจหมายถึงการก้าวไปข้างหน้า ผู้ให้บริการด้านการดูแลสุขภาพของคุณอาจสามารถเชื่อมต่อคุณได้ คุณยังสามารถตรวจสอบกับ National Society of Genetic Counselors ผ่านฐานข้อมูลออนไลน์ของพวกเขาเพื่อค้นหาหรือกับกลุ่มท้องถิ่นหรือระดับชาติที่คล้ายคลึงกัน

สรุป

สาขาวิชาพันธุศาสตร์กำลังเปลี่ยนแปลงแนวทางการรักษาพยาบาล และผู้คนต่างก็รู้ดีว่ายีนส่งผลต่อสุขภาพของพวกเขาอย่างไร ที่จะเป็นจริงมากขึ้นในอนาคต

สำหรับตอนนี้ มีการทดสอบหลายอย่างรวมถึง WES การทดสอบทางพันธุกรรมเหล่านี้อาจใช้ด้วยเหตุผลหลายประการ แต่การทดสอบเหล่านี้ล้วนมีไว้เพื่อช่วยให้คุณปกป้องสุขภาพของคุณหรือทำความเข้าใจว่าเหตุใดจึงเปลี่ยนแปลง ผลลัพธ์อาจทำให้เกิดความท้าทายชุดใหม่ แต่ผู้ให้บริการด้านการดูแลสุขภาพของคุณสามารถช่วยให้คุณรู้ว่าการทดสอบคืออะไร ผลลัพธ์หมายถึงอะไร และต้องทำอย่างไรต่อไป

WES ยังคงเป็นวิธีการทดสอบทางพันธุกรรมที่ค่อนข้างใหม่และยังไม่ชัดเจนว่าจะใช้งานได้ดีที่สุดอย่างไร หากการรักษาภาวะทางพันธุกรรมมีเป้าหมาย เช่นในกรณีของยาใหม่หลายๆ ตัว คุณอาจมีกำไรมากมายจากการทดสอบ แม้ว่าการทดสอบจะไม่เปลี่ยนการดูแลของคุณ แต่ก็ยังอาจช่วยในการพยากรณ์โรคหรือคำแนะนำสำหรับสมาชิกในครอบครัวที่มีความเสี่ยง แต่มีข้อมูลมากมาย ดังนั้นอย่าลืมคิดให้ดีว่าจะทำอะไรกับมัน